Biologiska filter kan vara såväl innerfilter som ytterfilter. Bland innerfilter kan nämnas såkallade bottenfilter, olika varianter med konstskumsmattor eller konstskumpatroner, Bio-max torn , våt/torra innerfilter och droppfilter som en del av akvariet.



Bottenfilter; vattnet passerar genom gruset i akvariet där bakterierna finns för att sedan sugas upp under bottenplattan ut i akvariet igen.
Bottenfilter är oftast effektiva men har nackdelen att de ska ligga under ev. sand i akvariet och de är då lite bökiga att rengöra. del av akvariet.


Filtermattor ger en mycket stor filteryta men passar kanske bäst i icke inredda prydnadsakvarier eftersom det kan vara svårt att dölja den inte allt för vackra filtermattan.
Olika filtervarianter med skumpatroner är ofta ett bra komplement i ett akvarium med stora diskusar och helt tillräckligt i akvarier för små diskusar. Det finns varianter som drivs av en elektrisk pump i akvariet men också luftdrivna varianter.

Bio-max torn är en filtervariant med ett antal svarta torn i akvariet (finns vägg för att dölja). Tornen kan innehålla olika typer av filtermaterial och har en förhållandevis stor volym. Jämfört med stora ytterfilter har de ett intressant pris.

De våt/torra filtren och interna droppfiltren är nog de mest effektiva om man har en stor filtervolym och ett substrat med mycket porer så att det blir en stor inre yta.
Det finns några våt/torra motordrivna innerfilter på marknaden. I dessa filter pulserar vattennivån upp och ner.
Interna droppfilter kan iordningställas genom att en del av akvariet avdelas med en glasvägg. Denna del inreds med filtermaterial, till exempel skumbitar eller biobollar. Ska man få bra effekt bör vattnet strila/duschas över substratet.

Bland ytterfiltren är de effektivaste de så kallade intervallfiltren. I dessa sjunker och stiger vattennivån vilket möjliggör för större mängder nyttiga bakterier att leva i filtret.
På marknaden efterfrågar akvarister allt starkare pumpar, det vill säga pumpar som kan pumpa så många liter som möjligt per timma. Det har emellertid visat sig att starka flöden motverkar uppbyggnaden av stora bakteriekulturer. Därför bör man vid konstruktion av egna filter inte satsa på kraftfulla pumpar i tron att det blir effektivare.